当归咖啡酸-O-甲基转移酶基因克隆和序列分析

• 作者: 夏琦 温随超 王引权 王振恒 荔淑楠 雒军
• 来源期刊: 中草药
• 学科: 医学
• 关键词: 当归 咖啡酸-O-甲基转移酶 基因克隆 生物信息学分析 信号肽
• 年，卷（期）: 2016,（7）
• 所属期刊栏目: 药材与资源
• 页码范围: 1180-1186
• 页数: 7页
• 分类号: R282.2
• 语种: 中文
• DOI: 10.7501/j.issn.0253-2670.2016.07.020

摘要

目的 克隆当归Angelica sinensis咖啡酸-O-甲基转移酶(caffeic acid O-methyltransferases,COMT)编码基因全长cDNA,并对序列进行生物信息学分析.方法 提取当归叶片总RNA为cDNA合成模板,利用同源克隆结合cDNA末端快速扩增(RACE)技术克隆当归COMT全长cDNA,并利用NCBI、ExPASy网站上的Blast N、Blast P、ORF Finder、Compute PI/Mw、ProtScale、PROSITE、SWISS-MODEL等序列在线分析工具和MEGA、DNAMAN生物信息学软件对序列进行分析.结果 获得COMT全长cDNA序列,并在GenBank注册(登录号KP188587).序列分析表明,克隆的cDNA全长为1 436 bp,其中包括5'-UTR (76 bp)和3'-UTR (362 bp),含有1个1 098 bp的完整开放阅读框(opening reading frame,ORF),编码365个氨基酸的多肽链;预测蛋白质相对分子质量为40 230,理论等电点(pI)为5.43;无信号肽,具有典型的Ⅱ型氧甲基转移酶结构域SAM OMT Ⅱ.结论 首次克隆当归COMT基因全长cDNA,为当归COMT基因功能研究和当归阿魏酸生物合成与调控的机制研究奠定基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王引权		51	322	10.0	16.0
2	王振恒		28	81	5.0	8.0
3	荔淑楠		15	36	4.0	6.0
4	夏琦		17	89	6.0	9.0
5	雒军		20	40	4.0	5.0
6	温随超		6	44	5.0	6.0