杉木不完整型EST-SSR特征分析

• 作者: 戴俊 李魁鹏 程琳 蓝肖 陈代喜 陈晓明 陈琴 黄开勇
• 来源期刊: 广西林业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 杉木 转录组 SSR类型
• 年，卷（期）: 2017,（4）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 350-353
• 页数: 4页
• 分类号: S791.27
• 字数: 2798字
• 语种: 中文

摘要

SSR可以分为完整型(不间断单一型)和不完整型(包含不间断复合型、间断单一型、间断复合型).本研究旨在分析杉木(Cunninghamia lanceolata)不完整型EST-SSR特征.结果表明:转录组搜索出5999个不间断单一型EST-SSR,占全部EST-SSR的97.78％,不完整型所包含3种类型EST-SSR的数量接近,SSR数量之和为136个,仅占转录组全部EST-SSR的2.22％.在杉木136个不完整型EST-SSR中,共有单核苷酸、二核苷酸、三核苷酸、四核苷酸、六核苷酸等5种基元重复类型.不间断复合型EST-SSR中基元重复类型的组合数最多,出现了7种组合,间断复合型出现5种组合,间断单一型出现3种组合.