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小麦幼苗内生菌多样性的宏基因组分析
小麦幼苗内生菌多样性的宏基因组分析
作者:
夏云磊
孙海燕
李伟
赵芹
邓渊钰
陈怀谷
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
小麦幼苗
内生菌
宏基因组
多样性
系统发育分析
摘要:
小麦是世界各地广泛种植的重要禾本科作物,在生长过程中与内生菌形成和谐共生的微生态体系,内生菌次生代谢产物具有抗病、防虫与促生等重要作用.宏基因组技术是研究环境微生物及内生菌多样性的重要手段.本研究首先富集纯化幼苗期小麦内生菌的宏基因组DNA,PCR扩增内生细菌的16S rDNA及内生真菌rDNA-ITS序列,构建了大肠杆菌克隆文库,选取阳性克隆测序.根据16S rDNA信息及系统进化树对内生细菌群初步分析,划分为9个分类操作单元(operational taxonomic unites,OTUs),主要包括γ-变形菌纲肠杆菌科(95.59%)、梭菌纲(1.47%)及不可培养细菌(2.94%),其中肠杆菌科菌群为优势菌.内生真菌rDNA-ITS克隆序列根据序列相似性和系统发育分析划归为13个OTUs,主要为不可培养真菌(37.50%)与子囊菌(62.50%),后者分属于半子囊菌纲(30.00%)、座囊菌纲(5.00%)与粪壳菌纲(27.50%)3个菌纲,其中不可培养真菌为优势菌.上述研究结果表明小麦幼苗内生菌遗传多样性分布较广,本研究为进一步挖掘利用小麦内生菌资源提供了基础信息.
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文献信息
篇名
小麦幼苗内生菌多样性的宏基因组分析
来源期刊
植物病理学报
学科
农学
关键词
小麦幼苗
内生菌
宏基因组
多样性
系统发育分析
年,卷(期)
2017,(3)
所属期刊栏目
病原学
研究方向
页码范围
313-324
页数
12页
分类号
S432
字数
语种
中文
DOI
10.13926/j.cnki.apps.000044
五维指标
作者信息
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陈怀谷
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李伟
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多样性
系统发育分析
研究起点
研究来源
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期刊影响力
植物病理学报
主办单位:
中国植物病理学会
出版周期:
双月刊
ISSN:
0412-0914
CN:
11-2184/S
开本:
大16开
出版地:
中国农业大学植保楼406室
邮发代号:
82-214
创刊时间:
1955
语种:
chi
出版文献量(篇)
2207
总下载数(次)
3
总被引数(次)
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