荷花花瓣着色过程实时荧光定量PCR内参基因的筛选及验证

• 作者: 周华 徐迎春 王彦杰 薛泽云 金奇江 陈叶清
• 来源期刊: 南京农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 花色 荷花 实时荧光定量PCR 内参基因
• 年，卷（期）: 2017,（3）
• 页码范围: 408-415
• 页数: 8页
• 分类号: S682.2
• 字数: 5458字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7685/jnau.201609033

摘要

[目的]选择稳定的内参基因是准确分析实时荧光定量PCR(RT-qPCR)结果的重要前提,本文旨在筛选荷花花瓣着色过程中稳定的内参基因,使目标基因的定量更加准确.[方法]以荷花4种不同花色(红、黄、粉、白)品种、不同花发育期(蕾期、初花期、盛花期、末花期)的花瓣为试材,利用RT-qPCR技术检测8个常用看家基因(ACT、EF1α、GAPDH、FPGS、TUA、LEU、CUL和TRY)的表达水平,并结合geNorm、NormFinder和BestKeeper软件对其表达稳定性进行评价.为了进一步验证8个候选基因的稳定性,分别以它们作为内参基因,检测目的基因查耳酮合成酶基因(CHS)的表达.[结果]geNorm软件分析表明,不同荷花花色品种及不同花发育期间,EF1α和ACT表达稳定性最好.NonnFinder和BestKeeper软件显示在不同花色品种中,EF1a和ACT的表达均较稳定;在不同花发育期间,NormFinder软件分析显示ACT表达最稳定,EF1α稳定性也相对较高,而Best-Keeper软件分析显示EF1α表达最稳定,但ACT稳定性较差.同时研究发现,GAPDH和TRY在所有样品中稳定性都较差.不同软件之间结果的差异可能是由算法不同造成.拟定EF1α和ACT为最适的内参基因,进一步利用CHS的表达分析验证了EF1α和ACT的稳定性.[结论]在荷花不同花色品种及不同花发育期间,使用EF1α和ACT2个表达最稳定的基因组合,即可获得更为精确的基因表达结果.本研究结果对荷花花瓣着色过程中关键基因表达的RT-qPCR分析具有重要的实用价值.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	徐迎春	南京农业大学园艺学院	91	1367	20.0	32.0
2	薛泽云	南京农业大学园艺学院	5	27	3.0	5.0
3	金奇江	南京农业大学园艺学院	10	31	3.0	5.0
4	王彦杰	南京农业大学园艺学院	11	31	3.0	5.0
5	陈叶清	南京农业大学园艺学院	2	24	2.0	2.0