低氮胁迫下高粱实时荧光定量PCR内参基因的筛选

• 作者: 孙毅 段永红 王玉国 马建华
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 学科: 农学
• 关键词: 高粱 低氮胁迫 内参基因 荧光定量PCR
• 年，卷（期）: 2017,（5）
• 所属期刊栏目: 研究资源与技术改进
• 页码范围: 805-812
• 页数: 8页
• 分类号: S514.01
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2017.05.012

摘要

实时定量PCR技术广泛应用于植物功能基因转录水平变化的研究,选择适当的内参基因是获得准确分析结果的关键.氮元素的吸收和利用是影响高粱(Sorghum bicolor)产量的重要决定因素.本研究选取7个常用内参基因肌动蛋白基因(Actin)、多聚泛素酶基因(ubiqutin conjugating enzyme,UBQ)、甘油醛-3-磷酸脱氢酶基因(glyceralde-hyde-3-phosphate dehydrogenase,GAPDH)、UBQ10、真核生物翻译起始因子2B(eukaryotic translation initiation factor 2B,EIF2B)、甘油醛-3-磷酸脱氢酶基因家族(glyceralde-hyde-3-phosphate dehydrogenase,sbGAPDH)和真核生物翻译起始因子4a(eukaryotic translation initiation factor 4a,EIF4a)作为候选内参基因,以高粱根和叶为材料,筛选低氮胁迫下高粱实时荧光定量PCR(qRT-PCR)实验体系的最佳内参基因.经引物特异性检测,各候选内参基因引物均符合稳定性筛选要求.荧光定量PCR分析结果表明,7个候选内参基因的表达水平和稳定性因组织和氮处理的不同而呈现差异.叶片中GAPDH较其他内参基因表达丰度高;而在根系中UBQ10表达丰度最高.应用GeNorm软件程序对候选内参基因稳定性进行评价.结果表明,内参基因GAPDH和EIF4a在叶片中的表达稳定性最高,而根系中表达稳定度最高的为sbGAPDH和EIF4a.本研究结果为高粱中低氮胁迫相关差异基因的表达分析提供了基础资料,同时可为其他作物的同类研究提供参考.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	段永红	山西农业大学农学院	52	412	9.0	19.0
2	孙毅	山西省农业科学院生物技术研究中心	143	2581	25.0	44.0
4	王玉国	山西农业大学农学院	75	742	16.0	24.0
5	马建华	山西省农业科学院生物技术研究中心	3	11	2.0	3.0