铝胁迫下橡胶苗实时荧光定量PCR内参基因的筛选

• 作者: 刘子凡 安锋 谢贵水 马小伟
• 来源期刊: 热带作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 橡胶树 铝毒 实时荧光定量PCR 内参基因
• 年，卷（期）: 2020,（5）
• 所属期刊栏目: 生物技术与组织培养
• 页码范围: 955-963
• 页数: 9页
• 分类号: S718.43
• 字数: 5189字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2020.05.015

摘要

铝毒是热带地区酸性土壤上抑制作物生长的主要因素,但目前关于铝活化后对橡胶树生长和产胶的影响及橡胶树耐铝机制的研究很少.为了筛选出橡胶树在铝毒胁迫下稳定表达的内参基因用于实时荧光定量PCR分析,本研究选择了Actin 、Actin7、18S rRNA、40S rRNA、YLS8、UBC2、UBC4、GAPDH、FP和ADF等10种常见的基因作为候选内参基因,通过qRT-PCR检测,利用内参基因评价软件geNorm、NormFinder、BestKeeper、Delta Ct算法以及综合评价软件 RefFinder 对 10 个候选内参基因的表达稳定性进行评估.综合评价结果表明,铝胁迫后表达稳定性排名前 3的内参基因依次分别为UBC4、40S rRNA和FP.进一步选取UBC4、40S rRNA、FP基因和UBC4+40S rRNA+FP基因组合以及稳定性较差的GAPDH基因作为内参基因对橡胶树铝诱导苹果酸分泌转运蛋白基因HbALMT-1和HbALMT-2进行相对表达分析,结果显示 2 个目的基因相对于 3 个内参基因及其组合均显示出一致的表达水平,而稳定性较差的内参基因 GAPDH 未能准确地对目的基因的表达量进行校正.综上所述,筛选出 UBC4、40S rRNA 和 FP 基因以及UBC4+40S rRNA+FP基因组合可作为铝毒胁迫不同天数下表达最稳定的内参基因,可用于铝毒胁迫下橡胶树相关基因的表达分析.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘子凡	海南大学热带作物学院	50	267	8.0	14.0