黄肉苹果转色期前后类胡萝卜素合成相关差异表达基因鉴定

• 作者: 丛佩华 宋成秀 张利义 张彩霞 田义
• 来源期刊: 园艺学报
• 学科: 农学
• 关键词: 苹果 黄肉 转录组 类胡萝卜素 MdCCD4
• 年，卷（期）: 2017,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 205-214
• 页数: 10页
• 分类号: S661.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.16420/j.issn.0513-353x.2016-0449

摘要

为了了解黄肉苹果种质成熟时富集类胡萝卜素的分子机制,以黄肉种质‘东北黄海棠’为材料,选择转色期前后(盛花后90 d和115 d)两个发育时期的果实进行RNA-seq测序,分析两个样本差异表达基因,并利用实时荧光定量PCR技术验证获得的类胡萝卜素合成相关差异表达基因的表达水平.结果获得两个样本显著差异表达基因共3 056个,与盛花后90 d果实比较,成熟期果实中有1 270个基因上调表达,1 786个基因下调表达.对这些表达差异基因进行了Pathway富集分析,结果显示差异表达基因涉及类胡萝卜素、苯丙氨酸以及类黄酮等代谢途径,其中类胡萝卜素代谢途径基因有3个上调,4个下调.通过对这7个差异表达基因进一步的qRT-PCR及聚类分析,发现一个新的候选基因MdCCD4b,该基因与菊花以及桃等CCD4聚为一类,与其他作物功能已知的CCD4一样,其表达水平与黄肉种质中类胡萝卜素积累呈负相关,推测黄肉种质果实成熟后类胡萝卜素的富集与MdCCD4b基因显著下调有关.