基于TCGA数据的肝癌预后相关miRNA筛选

• 作者: 徐斌 石旦 蒋敬庭
• 来源期刊: 临床检验杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 肝癌 miRNA筛选 TCGA数据库
• 年，卷（期）: 2017,（11）
• 所属期刊栏目: 肿瘤与微环境检测
• 页码范围: 818-821
• 页数: 4页
• 分类号: R735.7
• 字数: 1999字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13602/j.cnki.jcls.2017.11.05

摘要

目的 通过TCGA数据库中肝癌高通量测序数据的分析,寻找新的肝癌预后相关的miRNA,为后续研究提供数据支持.方法 下载TCGA数据库中miRNA表达数据及肝癌患者相关临床病理参数,基于R语言进行数据的整理、合并及标准化;分别采用单因素Cox生存分析模型及BhGLM R软件包中指数先验分布模型对miRNA表达数据进行分析,并选择两种方法筛选结果的交集.结果 单因素Cox生存分析模型共筛选出63个预后相关miRNA(P＜0.05),指数先验分布模型筛选出77个miRNA,两种方法共筛选出包括miR-188、miR-576、miR-887及miR-91等18个与肝癌患者预后密切相关的miRNA.结论 单因素Cox模型联合指数先验分布模型筛选出的肝癌预后相关miRNA具有较高的可信度,或可成为肝癌预后判断的新指标.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	蒋敬庭		19	30	3.0	4.0
2	石旦		2	1	1.0	1.0
3	徐斌		2	1	1.0	1.0