大豆GmABCG40基因的功能预测及表达分析

• 作者: 张宇航 李冬梅 李悦 李文滨 李永光 王涛 王珣 陈薇
• 来源期刊: 大豆科学
• 学科: 农学
• 关键词: 大豆 ABCG转运蛋白 表达分析 功能 生物信息学
• 年，卷（期）: 2017,（4）
• 所属期刊栏目: 遗传育种·分子生物学
• 页码范围: 502-507
• 页数: 6页
• 分类号: S565.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.11861/j.issn.1000-9841.2017.04.0502

摘要

通过在大豆基因组数据库中检索拟南芥AtABCG40在大豆中的同源基因,获得了mABCG40基因序列.通过对GGmABCG40基因编码的氨基酸序列及启动子序列进行生物信息学分析,结果表明:GmABCG40基因CDS序列全长4284 bp,编码1 427个氨基酸.GmnABCG40编码的蛋白为疏水性蛋白,具有多个N-糖基化位点、激酶磷酸化位点、N-豆蔻酰化位点、2个ATP/GTP结合位点基序A和1个速激肽家族信号.结构域分析表明GmABCG40含有2个核苷酸结合域与2个跨膜结构域,形成NBD1-TMDl-NBD2-TMD2结构,属于ABCG亚家族的成员.GmABCG40预测的启动子区域含有与激素、胁迫、光应答、胚乳表达和转录因子结合相关的顺式作用元件.系统进化分析表明GmABCGG40与菜豆、红豆、木豆、百脉根等豆科植物亲缘关系较近.组织特异性表达分析结果显示GmDABCG 40在叶片中表达量最低,在根中表达量最高,推测其可能参与根中ABA的转运过程.