大豆GmMP基因的功能预测及表达分析

• 作者: 张可欣 李冬梅 李文滨
• 来源期刊: 大豆科学
• 学科: 农学
• 关键词: 大豆 GmMP基因 生长素 生物信息学
• 年，卷（期）: 2017,（1）
• 所属期刊栏目: 遗传育种·分子生物学
• 页码范围: 28-32
• 分类号: S565.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.11861/j.issn.1000-9841.2017.01.0028

摘要

通过在大豆基因组数据库中检索拟南芥AtMP(ARF5)在大豆中的同源基因,获得了GmMP基因序列.对GmMP基因编码的氨基酸序列及启动子序列进行生物信息学分析,结果表明:GmMP基因CDS序列全长2 802 bp,编码933个氨基酸.GmMP编码的蛋白为疏水性蛋白.结构域分析表明:GmMP含有B3和AUXIN RESPONSE FACTOR结构域,同时该基因是ARF家族的成员.GmMP预测的启动子区域含有与激素、胁迫、光应答、生物钟调控和转录因子结合相关的顺式作用元件.系统进化分析表明MP在豆科植物进化过程中比较保守.组织特异性表达分析结果显示GmMP在叶片中表达量最低,在茎尖中表达量最高,推测其可能参与生长素的代谢途径.