新型Vip3-like蛋白的从头预测建模及其结构域分析

• 作者: 张娟 张文飞 王俊慧 蒙瑜 龚建如
• 来源期刊: 海南师范大学学报（自然科学版）
• 学科: 工学
• 关键词: 营养期杀虫蛋白 苏云金芽孢杆菌 从头预测法 结构域
• 年，卷（期）: 2017,（3）
• 所属期刊栏目: 生物科学
• 页码范围: 269-275,296
• 页数: 8页
• 分类号: TP391
• 字数: 3521字
• 语种: 中文
• DOI: 10.12051/j.issn.1674-4942.2017.03.005

摘要

Vip3-like蛋白对小菜蛾等鳞翅目昆虫有杀虫活性,是苏云金芽孢杆菌营养期杀虫蛋白Vip3的同源蛋白.为建立Vip3-like三维结构的理论模型并对其结构域进行生物信息学分析,选择从头预测的方法对Vip3-like蛋白三维结构的理论模型进行预测分析.分析结果表明,Vip3-like蛋白由1个Vip3A-N超家族结构域和3个糖类结合结构域组成.与模式蛋白Vip3Aa相比,Vip3-like是一种分子量更大的蛋白质,且2种蛋白的表面静电势分布也存在差异.其Vip3A-N结构域仅由α螺旋和无规则卷曲组成,没有发现β折叠.3个糖类结合结构域主要由无规则卷曲和β折叠组成,仅存在1个α螺旋结构.结构域分析预示无规则卷曲和β折叠可能在Vip3-like和受体结合的过程中扮演着重要角色.通过比较分析,发现Vip3Aa和Vip3-like蛋白在三级结构上存在较大差异,仅仅在局部结构存在一定的相似性,Vip3-like可能并不属于Vip3 Aa类蛋白家族而属于一种全新的Bt营养期杀虫蛋白质.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张娟	海南师范大学热带动植物生态学省部共建教育部重点实验室	14	6	2.0	2.0
2	龚建如	海南师范大学热带动植物生态学省部共建教育部重点实验室	2	0	0.0	0.0
3	王俊慧	海南师范大学热带动植物生态学省部共建教育部重点实验室	1	0	0.0	0.0
4	蒙瑜	海南师范大学热带动植物生态学省部共建教育部重点实验室	1	0	0.0	0.0