矮秆大豆SGF14h蛋白结构和功能的生物信息学预测和分析

• 作者: 孟德义 张达 徐庆华 杜洋 赵虎 郝再彬 郭人铭
• 来源期刊: 中国油料作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 矮秆大豆 SGF14h 生物信息学 结构和功能
• 年，卷（期）: 2017,（2）
• 所属期刊栏目: 遗传育种
• 页码范围: 152-159
• 页数: 8页
• 分类号: S565.1
• 字数: 5815字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7505/j.issn.1007-9084.2017.02.003

摘要

为了研究本实验室前期质谱分析筛选出的SGF14h蛋白的生物学功能,并为研究SGF14h基因的表达调控提供理论依据,使用一系列生物信息学软件、数据库和在线程序,对大豆SGF14h蛋白序列及核酸序列进行分析和预测.SGF14h基因结构分析显示:该基因位于第4号染色体上,全长1 788bp,其中开放阅读框长780bp,编码259个氨基酸.SGF14h蛋白属性分析显示:序列中富含磷酸化位点(丝氨酸磷酸化位点10个和苏氨酸磷酸化位点3个);此蛋白为非分泌型蛋白、无跨膜结构域;预测其定位于线粒体.SGF14h蛋白结构分析显示:二级结构有153个α螺旋,无β折叠和β转角;为亲水性蛋白质;属于14-3-3蛋白家族成员.SGF14h蛋白进化树分析表明:该蛋白与玉米GF14蛋白亲缘性最近.矮秆大豆中,SGF14h可能在GA信号转导中起重要作用,进而影响株高.因此对SGF14h的研究具有生物学意义,此结果可为进一步验证大豆SGF14h蛋白的生物学功能提供借鉴和理论依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张达	东北农业大学生命科学学院	39	406	11.0	19.0
2	郝再彬	桂林理工大学化学与生物工程学院	50	247	9.0	13.0
3	徐庆华	东北农业大学生命科学学院	23	70	5.0	7.0
4	赵虎	东北农业大学生命科学学院	3	8	2.0	2.0
5	杜洋	东北农业大学生命科学学院	4	16	2.0	4.0
6	孟德义	东北农业大学生命科学学院	3	5	1.0	2.0
7	郭人铭	东北农业大学生命科学学院	3	32	3.0	3.0