基于HSMM和K-means的纳米孔多级事件检测

• 作者: 王慧锋 赖永杭 颜秉勇
• 来源期刊: 华东理工大学学报（自然科学版）
• 学科: 工学
• 关键词: 纳米孔 HSMM K-means 多级事件
• 年，卷（期）: 2017,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 220-226
• 页数: 7页
• 分类号: TH776
• 字数: 4878字
• 语种: 中文
• DOI: 10.14135/j.cnki.1006-3080.2017.02.011

摘要

提出了一种基于隐半马尔科夫模型(HSMM)和K-means的混合算法,用于对纳米孔数据中出现的多级事件进行分析.通过K-means对检测到的阻断事件进行分析,确定纳米孔信号中的电流幅值水平个数,将其作为HSMM模型的隐状态输入;然后采用HSMM识别多级事件内部的不同水平,确定各水平的幅值和持续时间.最后将算法与Opennanopore软件进行比较,对三级、四级事件进行处理.仿真结果发现:HSMM比Opennanopore软件的准确率高,能够准确对事件进行分级.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王慧锋	华东理工大学信息科学与工程学院	50	388	10.0	18.0
2	颜秉勇	华东理工大学信息科学与工程学院	18	64	4.0	7.0
3	赖永杭	华东理工大学信息科学与工程学院	1	0	0.0	0.0