陆地棉LTR反转录转座子的数量分布与功能分析

• 作者: 刘震 卢全伟 张国强 彭仁海
• 来源期刊: 河南师范大学学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 陆地棉 LTR反转录转座子 分布 功能
• 年，卷（期）: 2017,（6）
• 所属期刊栏目: 生命科学
• 页码范围: 72-78
• 页数: 7页
• 分类号: Q341
• 语种: 中文
• DOI: 10.16366/j.cnki.1000-2367.2017.06.012

摘要

LTR(Long terminal repeat)反转录转座子是真核生物基因组中普遍存在的一类遗传因子,它们以RNA为媒介在基因组中不断自我复制.在高等植物中,LTR反转录转座子是基因组的重要成分之一.本研究通过多种方法挖掘并注释了陆地棉基因组中的LTR反转录转座子,结果表明陆地棉基因组LTR反转录转座子的Gypsy超家族与基因的分布呈近似的反比关系,而Copia超家族在各染色体的起始端有较多的分布.通过皮尔森相关系数发现陆地棉LTR反转录转座子的拷贝数与染色体大小之间有强相关性.在LTR反转录转座子上游和下游分布的基因具有类似的富集特征,其分子功能主要集中在结合和催化活性等方面.本研究结果加深了对陆地棉LTR反转录转座子的认识,为深入研究棉花基因组提供了重要数据支撑.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张国强		21	76	4.0	8.0
2	彭仁海		28	40	3.0	5.0
3	卢全伟		18	34	3.0	5.0
4	刘震		9	6	1.0	2.0