儿童恶性疟疾患者外周血基因表达谱的改变及生物信息学特征分析

• 作者: 何秋仙 张荣强 彭晶 杨维
• 来源期刊: 现代检验医学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 疟原虫 疟疾 差异表达基因 生物信息学
• 年，卷（期）: 2017,（4）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 36-39
• 页数: 4页
• 分类号: R725.3|Q786
• 字数: 3418字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1671-7414.2017.04.010

摘要

目的 分析儿童恶性疟疾患者外周血基因表达谱、关键蛋白的改变及其生理学功能,为疟疾防治提供新依据.方法 从基因芯片公共数据库GEO中获得疟疾惠儿外周血基因芯片数据,共5例疟疾患儿,均依据WHO疟疾诊断标准明确诊断,采用自体匹配设计,每位患儿分别在轻症、重症疟疾时采集外周血;分析不同病情患儿的基因表达谱、蛋白相互作用网络、分子生物学过程、基因功能,寻找疟疾惠儿病情进展相关的关键基因.结果 623个(1.93％)差异表达基因可鉴别区分轻症、重症患儿;OAS2,OAS3,IFIT3和USP18基因是差异基因蛋白-蛋白交互作用网络(protein-protein interac-tions,PPI)中子网络的核心节点;差异表达基因主要参与机体的免疫防御、免疫应答、对外部刺激应答、干扰素-1型通路的活化等生物学功能.结论 疟疾患儿病情的进展可能受OAS2,OAS3,IFIT3和USP18等基因的调控,儿童的免疫防御能力下降与病情进展具有重要的关系.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨维	西安市中医医院检验科	5	34	3.0	5.0
2	何秋仙	陕西省人民医院体检中心	12	77	6.0	8.0
3	彭晶	西安市中医医院检验科	6	3	1.0	1.0
4	张荣强	陕西中医药大学公共卫生学院	68	140	6.0	8.0