大豆FLAs蛋白理化性质和结构特征的生物信息学分析

• 作者: 吴小明 胡颖 钟静
• 来源期刊: 河南农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 大豆 类成束阿拉伯半乳糖蛋白 理化性质 结构特征 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2017,（3）
• 所属期刊栏目: 作物栽培·遗传育种
• 页码范围: 34-40
• 页数: 7页
• 分类号: S565.1
• 字数: 3770字
• 语种: 中文
• DOI: 10.15933/j.cnki.1004-3268.2017.03.007

摘要

基于已公布的大豆基因组数据库,鉴定大豆类成束阿拉伯半乳糖蛋白(fasciclin-like arabinogalactan proteins,FLAs)基因,并对其基本理化性质、保守基序、功能域、系统发生树、蛋白质二级结构等进行综合分析.结果显示,从大豆基因组中共鉴定出33个FLAs,其编码的蛋白质氨基酸长度在237~455 aa,分子质量在25.483 0~50.578 5 ku,理论等电点在4.33~9.56.亚细胞定位分析显示,GmFLAs均定位在质膜上(其中GmFLA4/25也可定位在叶绿体中).GmFLAs含有1~2个该家族的保守成束蛋白质结构域(fasciclin domains,FAS).系统进化分析显示,大豆和拟南芥FLAs的同源性不高.GmFLAs二级结构均由α螺旋、无规则卷曲和延伸链等元件组成,其中,延伸链的比例最低,无规则卷曲比例最高.