荧光标记LDR-PCR复合扩增方法对高度降解DNA检材的SNPs分型研究

• 作者: 丁梅 夏皙 姚军 孙溢华 宣金锋 庞灏 李春梅 王保捷 邢佳鑫
• 来源期刊: 中国医科大学学报
• 学科: 医学
• 关键词: 法医物证学 连接酶检测反应 复合扩增 降解DNA 单核苷酸多态性
• 年，卷（期）: 2017,（8）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 703-709
• 页数: 7页
• 分类号: R89
• 字数: 2940字
• 语种: 中文
• DOI: 10.12007/j.issn.0258-4646.2017.08.008

摘要

目的 构建一套基于连接酶检测反应(LDR)的荧光标记PCR复合扩增体系,为解决高度降解DNA法医学分析提供新的策略.方法 选择8个单核苷酸多态性(SNPs)位点(rs10802248、rs10516197、rs10488372、rs2278945、rs4757318、rs4887255、rs4889002和rs9304473),设计合成各SNPs位点的LDR探针和连接产物PCR引物,通过LDR将连接产物进行PCR扩增,并将扩增产物进行毛细管凝胶电泳,构建复合扩增SNPs分型体系.结果 使用荧光标记LDR-PCR复合扩增方法,对不同个体的8个SNPs位点进行分型,分型结果与测序结果完全一致;对于甲醛固定石蜡包埋组织(FFPET)检材高度降解的DNA样品,荧光标记LDR-PCR复合扩增体系能够实现8个SNPs位点的准确分型.结论 荧光标记LDR-PCR复合扩增方法能够对8个SNPs位点进行一次性分型,结果准确、可靠,是一种简单、高效并且较为实用的SNPs分型新方法,适用于高度降解检材的检测.