焦磷酸测序快速检测3种海洋性弧菌的方法学建立及创伤弧菌16S rRNA基因分型的研究

• 作者: 周月霞 张丽娜 胡成进 郑妍 陈英剑
• 来源期刊: 临床检验杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 海洋性弧菌 焦磷酸测序 快速诊断 聚合酶链式反应
• 年，卷（期）: 2017,（7）
• 所属期刊栏目: 临床检验技术研究
• 页码范围: 481-485
• 页数: 5页
• 分类号: R446.5
• 字数: 3475字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13602/j.cnki.jcls.2017.07.01

摘要

目的 建立一种海洋致病性弧菌的快速诊断方法,为海洋性弧菌感染的临床检测构建新的技术平台.方法 分别针对创伤弧菌vvhA,副溶血弧菌和溶藻弧菌的toxR基因设计扩增引物和测序引物,并PCR扩增特异性DNA片段,制备单链模板,进行焦磷酸测序,得到的碱基序列经NCBI比对验证;对创伤弧菌16S rRNA基因进行分型.结果 创伤弧菌的扩增引物和测序引物均表现出较好的特异性,4株创伤弧菌均扩增出167 bp大小的DNA片段,并且测序结果与NCBI比对达到100％匹配度,而其他菌株未见扩增条带,测序结果为阴性;11株副溶血弧菌和溶藻弧菌均分别扩增出105 bp和134 bp大小的DNA片段,并且经测序得到与预期相符的DNA碱基序列.4株创伤弧菌中1株属于16S rRNA-A型,其余3株均属于16S rRNA-B型.结论 本研究建立的PCR-焦磷酸测序方法是一种短核苷酸序列实时测定的新方法,具有高通量、精确、简单易行的优点,适用于海洋性致病菌及陆地感染细菌的快速精准鉴定.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	胡成进	济南军区总医院实验诊断科	192	858	15.0	20.0
2	陈英剑	济南军区总医院实验诊断科	106	596	13.0	18.0
3	张丽娜	济南军区总医院实验诊断科	8	2	1.0	1.0
4	周月霞	济南军区总医院实验诊断科	2	2	1.0	1.0
5	郑妍	青岛慧康医院检验科	1	0	0.0	0.0