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摘要:
[目的]为研究兰花(Phalaenopsis equestris)中PI-PLC基因家族各成员在兰花中的生理功能.[方法]利用兰花基因组数据库,经过生物信息学分析,获得兰花PI-PLC基因家族成员的基因结构、染色体定位和编码蛋白,经过多重序列比对进行进化和分类分析.[结果]结果表明:兰花基因组中含有3个PI-PLC家族基因成员,分别含有9~13个外显子.TMHMM跨膜区结构分析显示,兰花PI-PLC蛋白均不合有跨膜区;MEME保守结构域分析显示,兰花PI-PLC蛋白均含有4个保守的EF、X、Y和C2结构域.[结论]以上结果对解析兰花PI-PLC蛋白的生物学功能提供重要的线索.
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文献信息
篇名 兰花磷酸肌醇特异性磷脂酶C基因家族生物信息学分析
来源期刊 西南农业学报 学科 农学
关键词 磷酸肌醇特异性磷脂酶C 兰花 基因家族 进化分析
年,卷(期) 2017,(10) 所属期刊栏目 作物遗传育种·种质资源
研究方向 页码范围 2218-2223
页数 6页 分类号 S682.31
字数 4024字 语种 中文
DOI 10.16213/j.cnki.scjas.2017.10.010
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 魏建华 北京市农林科学院农业基因资源与生物技术北京市重点实验室 30 439 11.0 20.0
2 王宏芝 北京市农林科学院农业基因资源与生物技术北京市重点实验室 16 187 8.0 13.0
3 陈亚娟 北京市农林科学院农业基因资源与生物技术北京市重点实验室 7 10 2.0 3.0
4 胡广隆 北京市农林科学院农业基因资源与生物技术北京市重点实验室 5 29 2.0 5.0
5 张杰伟 北京市农林科学院农业基因资源与生物技术北京市重点实验室 8 8 1.0 2.0
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磷酸肌醇特异性磷脂酶C
兰花
基因家族
进化分析
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西南农业学报
月刊
1001-4829
51-1213/S
大16开
成都市外东沙河大桥侧
62-152
1982
chi
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