基于miRNA-靶位点配对的序列特征研究

• 作者: 刘冬宁 夏飞迪 张巍 滕少华 王洋 邹小勇
• 来源期刊: 分析测试学报
• 学科: 化学
• 关键词: miRNA 靶基因识别 CLASH 序列分析
• 年，卷（期）: 2017,（5）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 614-620
• 页数: 7页
• 分类号: O629.74|TB9
• 字数: 5102字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1004-4957.2017.05.006

摘要

miRNA与其靶基因的作用机制十分复杂,因此,miRNA靶基因识别问题一直是miRNA研究领域的热点难题.该文基于CLASH数据集,提出了miRNA-靶位点配对序列特征,并使用随机森林建模.实验结果表明,本模型的Acc,Sen,Spe,Pre以及Mcc分别达到90.05％,89.47％,90.56％,90.43％和0.799 8;ROC和PRC的AUC分别为0.954,0.958.相比已有方法,该方法表现出更加良好的性能,说明新引入的miRNA-靶位点配对序列特征对miRNA靶基因识别有很重大的影响.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	邹小勇	中山大学化学学院	83	1011	19.0	28.0
2	滕少华	广东工业大学计算机学院	121	825	15.0	20.0
3	王洋	中山大学化学学院	17	179	5.0	13.0
4	张巍	广东工业大学计算机学院	62	412	11.0	15.0
5	刘冬宁	广东工业大学计算机学院	42	183	8.0	11.0
6	夏飞迪	广东工业大学计算机学院	1	3	1.0	1.0