地黄甲基转移酶/去甲基化酶基因的注释及其在块根发育过程中的表达分析

• 作者: 孙鹏 廖登群 李先恩 祁建军
• 来源期刊: 中国科技论文
• 学科: 生物学
• 关键词: 中药资源 地黄 DNA甲基转移酶 DNA去甲基化酶 转录组 块根发育 数字基因表达谱
• 年，卷（期）: 2017,（18）
• 页码范围: 2135-2140
• 页数: 6页
• 分类号: Q786
• 字数: 4394字
• 语种: 中文

摘要

利用Windows-BLAST软件同源比较分析获得地黄转录组中的DNA甲基转移酶/去甲基化酶基因,同时利用基因表达谱测序方法分析这些基因在地黄不同发育时期块根中的转录子水平.利用拟南芥11个C5-M T ase和4个DM ase基因的蛋白序列进行同源性比对,在地黄转录组中共获得了18个DNA甲基转移酶unigene和11个去甲基化酶unigene.差异表达基因(DEG)分析显示,11个DNA甲基转移酶unigene和5个去甲基化酶unigene在块根的发育过程中表达具有差异,随块根发育成熟转录子表达含量逐渐降低,说明甲基化基因参与调控地黄块根的发育.首次挖掘和分析了地黄基因组中DNA甲基转移酶/去甲基化酶基因的分布和表达,为进一步研究DNA甲基化在地黄块根发育以及连作下块根生长受抑的表观遗传学分子机理奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	祁建军	中国医学科学院中国协和医科大学药用植物研究所	59	458	12.0	19.0
2	李先恩	中国医学科学院中国协和医科大学药用植物研究所	110	1048	17.0	27.0
3	孙鹏	中国医学科学院中国协和医科大学药用植物研究所	30	233	9.0	14.0
4	廖登群	中国医学科学院中国协和医科大学药用植物研究所	9	39	4.0	6.0