新疆哈萨克绵羊MHC Ⅰ类分子基因的克隆与生物信息学分析

• 作者: 刘志方 赵阳 陈创夫 马齐蔓
• 来源期刊: 黑龙江畜牧兽医（上半月）
• 学科: 农学
• 关键词: 新疆哈萨克绵羊 主要组织相容性复合体(MHC)Ⅰ类分子基因 基因多态性 PCR 测序 生物信息学
• 年，卷（期）: 2017,（9）
• 所属期刊栏目: 遗传育种与繁殖
• 页码范围: 108-113,293-294
• 页数: 1页
• 分类号: S826|Q785
• 语种: 中文

摘要

为了研究新疆哈萨克绵羊主要组织相容性复合体(MHC)Ⅰ类分子基因序列的多态性,采用PCR和测序的方法分别克隆新疆哈萨克绵羊MHC Ⅰ类分子基因重链和轻链的cDNA全长,并进行生物信息学分析.结果表明:成功扩增出新疆哈萨克绵羊MHC Ⅰ类分子基因重链、轻链,大小分别为1 107 bp、357 bp;通过生物信息学软件预测蛋白质分子质量分别为90 ku和29.694 ku;等电点(pⅠ)分别为5.00,5.23;重链富含G、C碱基,有两段跨膜螺旋,最大疏水指数为3.622,最小疏水指数为-2.922,预测整条肽链表现为亲水性,在1～84位碱基之间存在信号肽;轻链四种碱基含量基本一致,也有两段跨膜螺旋,在1～63位碱基之间存在信号肽.新疆哈萨克绵羊MHC Ⅰ类分子基因编码蛋白质的二级结构以无规则卷曲元件的含量最高,该蛋白质的三级结构由一条α链,另一条为β链通过非共价键组成,由α1、α2组成抗原结合槽;NCBI数据库中不同地区的哈萨克绵羊的MHC Ⅰ类分子基因的同源性在89.87％～99.91％之间,与数据库中牛的MHC Ⅰ类分子基因同源性达到了98.88％,轻链MHC Ⅰ类分子基因还与猪和人的同源性相对较高.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈创夫		192	732	14.0	17.0
2	刘志方		2	4	1.0	2.0
3	马齐蔓		2	0	0.0	0.0
4	赵阳		4	4	1.0	2.0