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摘要:
应用BLAST比对技术,在松材线虫基因组数据中鉴定得到模式线虫pdk-1的同源基因Bxpdk-1.结合RT-PCR技术进行Bxpdk-1基因完整蛋白编码区(CDS)扩增,得到CDS区全长2298 bp.BxPDK-1蛋白含有"STKc_PDK1""PH_PDK1"2个保守结构域,属于磷酸肌醇激酶超家族.序列比对及进化树分析显示,松材线虫BxPDK-1蛋白与捻转血矛线虫PDK-1蛋白(CDJ88126.1)同源性为50%,进化树聚在同一小分支上,亲缘关系较近.原位杂交试验表明,Bxpdk-1基因主要在线虫的头部神经元及咽部神经处表达.qPCR结果分析显示,Bxpdk-1基因表达响应鱼藤酮药剂胁迫处理.RNAi试验显示,Bxpdk-1在dsRNA处理12 h时,基因表达量显著下降,基因被沉默.
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文献信息
篇名 松材线虫磷酸肌醇依赖性蛋白激酶1基因的克隆及表达
来源期刊 湖南农业大学学报(自然科学版) 学科 农学
关键词 松材线虫 磷酸肌醇依赖性蛋白激酶1基因 基因克隆 原位杂交 表达分析 RNA干扰
年,卷(期) 2018,(5) 所属期刊栏目 生物科学与技术
研究方向 页码范围 479-486
页数 8页 分类号 S763.18
字数 5569字 语种 中文
DOI 10.13331/j.cnki.jhau.2018.05.006
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 马玲 东北林业大学林学院 102 944 13.0 27.0
2 周天华 菏泽学院农业与生物工程学院 24 65 5.0 7.0
3 王步勇 菏泽学院农业与生物工程学院 1 0 0.0 0.0
4 问荣荣 菏泽学院农业与生物工程学院 1 0 0.0 0.0
5 张萌 菏泽学院农业与生物工程学院 1 0 0.0 0.0
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研究主题发展历程
节点文献
松材线虫
磷酸肌醇依赖性蛋白激酶1基因
基因克隆
原位杂交
表达分析
RNA干扰
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
湖南农业大学学报(自然科学版)
双月刊
1007-1032
43-1257/S
大16开
长沙市芙蓉区湖南农业大学内
42-157
1951
chi
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6
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