水稻纹枯病菌谷胱甘肽S-转移酶基因的生物信息学及表达分析

• 作者: 周而勋 张云欢 王陈骄子 舒灿伟 赵美 郑文博
• 来源期刊: 华北农学报
• 学科: 农学
• 关键词: 水稻纹枯病菌 谷胱甘肽S-转移酶 菌核发育 酶活测定 基因组定位
• 年，卷（期）: 2018,（1）
• 页码范围: 45-51
• 页数: 7页
• 分类号: S432.1|Q78
• 字数: 6184字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7668/hbnxb.2018.01.008

摘要

通过生物信息学方法及表达分析对水稻纹枯病菌谷胱甘肽S转移酶基因(Rsgst)的功能进行探索.通过水稻纹枯病菌RSIADB基因组数据库查找Rsgst序列,确定该基因在水稻纹枯病菌基因组中的精确位置.利用生物信息学软件预测Rsgst编码蛋白氨基酸序列的基本信息,并使用 MEGA 5.0软件构建同源蛋白的系统发育树,最后用qRT-PCR检测Rsgst在菌核发育过程中的基因表达量,同时测定GST的酶活性.结果表明,Rsgst全长1207 bp,该基因共编码277个氨基酸残基,其编码蛋白分子量为30.90 ku,理论等电点为9.42.该蛋白二级结构中以α-螺旋为主,占41.52%.系统发育树表明,水稻纹枯病菌GST蛋白与担子菌类玉米丝黑穗病菌GST蛋白亲缘关系最近.qRT-PCR结果表明,Rsgst在水稻纹枯病菌菌核发育过程中表达量不断上调,基因最高表达量是在第60小时,为7.64,而Rsgst的最高酶活性是在第5天,其酶活为0.375 U/μg.结果可为预测水稻纹枯病菌中Rsgst基因的功能奠定基础.