基于SNP位点的身高预测模型的评估

• 作者: 刘京 刘凡 叶健 孙亚男 景晓溪 李彩霞 江丽 焦会永 赵雯婷 黄艳梅
• 来源期刊: 法医学杂志
• 学科: 政治法律
• 关键词: 法医遗传学 法医人类学 单核苷酸多态性 身高 预测 汉族
• 年，卷（期）: 2018,（2）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 132-137
• 页数: 6页
• 分类号: DF795.2
• 字数: 4155字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1004-5619.2018.02.005

摘要

目的 根据报道的547个欧洲人群身高相关SNP位点构建中国汉族男性身高预测模型,评估此模型预测身高的准确性.方法 采用Affymetrix SNP Array 6.0芯片和HiSeq 4000测序平台对59例山东汉族男性样本进行DNA分型检测,并将这547个身高相关SNP位点作为预测因子,采用加权等位基因求和(weight allele sums,WAS)的计算方法建立预测模型.通过受试者工作特征曲线及曲线下面积(area under curve,AUC)对身高预测模型的准确性进行分析.结果 样本全基因组关联分析未发现身高显著相关SNP位点.本研究用WAS法构建身高预测模型,获得的AUC值为0.67(95％置信区间为0.53～0.90).结论 用547个SNP位点的WAS模型预测山东汉族男性群体身高具有参考价值,但预测模型准确度的进一步提升需要通过筛选更多具有人群特异性的身高相关SNP位点来实现.