黔北麻羊TYR基因多态性及生物信息学分析

• 作者: 封竣琪 徐伟 罗卫星 罗铮 翁吉梅 蔡惠芬 黄兰
• 来源期刊: 中国畜牧杂志
• 学科: 农学
• 关键词: 黔北麻羊 TYR基因 SNPs 生物信息学
• 年，卷（期）: 2018,（1）
• 所属期刊栏目: 遗传育种
• 页码范围: 60-64
• 页数: 5页
• 分类号: S827.2
• 字数: 3757字
• 语种: 中文
• DOI: 10.19556/j.0258-7033.2018-01-060

摘要

为研究黔北麻羊毛色形成的遗传机制,本实验对黔北麻羊哺乳动物酪氨酸酶(TYR)基因外显子区域运用混合DNA池结合PCR产物直接测序方法进行多态性分析,在TYR基因外显子区域共筛选出5个SNPs,分别为Exon1-G617A、Exon1-G685T、Exon3-C 1236T (Asn-Lys)、Exon5-C1578T (Gly-Glu)、Exon5-T1862C;进而利用生物信息学分析软件对PCR扩增所获序列进行mRNA二级结构及蛋白质二级结构和三级结构分析,发现Exon3-C 1236T(Asn-Lys)、Exon5-C1578T (Gly-Glu)引起mRNA二级结构的改变,其中Exon 1-G685T、Exon3-C1236T (Asn-Lys)、Exon5-T1862C突变导致其mRNA二级结构最小自由能增大,即二级结构稳定性降低,其错义突变位点Exon3-C 1236T(Asn-Lys)、Exon5-C1578T (Gly-Glu)均引起蛋白质二级结构和三级结构的改变.