烟草疫霉SSR分子标记的开发与初步应用

• 作者: 刘精精 崔林开 康业斌 胡艳红 赵启美 高鹏飞
• 来源期刊: 植物病理学报
• 学科: 农学
• 关键词: 烟草疫霉 SSR 筛选 聚类分析
• 年，卷（期）: 2018,（4）
• 所属期刊栏目: 细胞生物学、生理学、生物化学、分子生物学
• 页码范围: 474-481
• 页数: 8页
• 分类号: S435.72
• 语种: 中文
• DOI: 10.13926/j.cnki.apps.000175

摘要

为开发烟草疫霉的SSR分子标记,利用MISA软件搜索烟草疫霉基因组序列中的SSR位点,共发现1 311个SSR位点,优势SSR位点为二核苷酸和三核苷酸,分别占总SSR位点的56.45％和39.36％;根据分析到的SSR位点使用Primer 5.0软件设计48对SSR引物,以7株烟草疫霉的DNA为模板对这些引物进行筛选,共获得扩增条带清晰且具有多态性的SSR引物20对,然后使用其中的6对SSR对32株烟草疫霉进行UPGMA聚类分析,遗传相似系数在0.60～1.00之间,在相似系数0.70水平上,可将其划分为3个类群,类群Ⅰ包含29个菌株,类群Ⅱ包含1个菌株,类群Ⅲ包含2个菌株,显示出较低的遗传分化水平.这些SSR引物的开发将为研究我国烟草疫霉的遗传多样性、群体遗传结构以及遗传图谱构建等奠定基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	崔林开		14	72	5.0	8.0
2	康业斌		61	370	10.0	16.0
3	胡艳红		14	100	6.0	9.0
4	赵启美		8	123	6.0	8.0
5	高鹏飞		5	4	1.0	1.0
6	刘精精		2	3	1.0	1.0