北极狐CBD103基因序列生物信息学分析及启动子预测

• 作者: 冯敏山 刘艳军 刘铮铸 巩元芳 张文香 彭永东 李祥龙 牛迪 郭敏
• 来源期刊: 黑龙江畜牧兽医（上半月）
• 学科: 农学
• 关键词: 北极狐 CBD103基因 5'侧翼区 启动子 转录因子结合位点 结构功能 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2018,（1）
• 所属期刊栏目: 试验研究
• 页码范围: 52-56,251-252
• 页数: 1页
• 分类号: S826.2
• 语种: 中文
• DOI: 10.13881/j.cnki.hljxmsy.2017.06.0040

摘要

为了研究北极狐CBD103基因核心启动子活性区、转录因子结合位点、CBD103基因编码蛋白结构及功能,同时探究该基因的表达调控机制,试验通过RT-PCR扩增及测序技术从北极狐皮肤组织中获得CBD103基因cDNA序列,并利用生物信息学方法对所得序列进行预测分析.结果表明:获得序列全长2 327 bp(包括5'侧翼区2 071 bp、CDs区204 bp、3'侧翼区52 bp),编码67个氨基酸残基.北极狐CBD103基因5'侧翼区存在潜在的启动子区域和CpG岛,且发现GC框、TATA框、CAAT框等调控元件及Sp1、Ets、Mef-2、ERE、Myc等多种转录因子.CBD103基因编码的蛋白是定位于细胞核和线粒体的不稳定疏水性蛋白质,此蛋白无规卷曲所占比例较大,使得蛋白构象多样化,主要参与信号转导和转录,存在跨膜区域和信号肽.北极狐与家犬的遗传亲缘关系最近.说明CBD103基因在不同物种间具有一定的保守性,且各物种间亲缘关系与生物进化观点基本一致,同时符合动物分类学.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张文香		33	149	8.0	11.0
2	李祥龙		85	260	9.0	11.0
3	巩元芳		31	196	6.0	14.0
4	刘铮铸		22	12	2.0	3.0
5	冯敏山		17	40	4.0	6.0
6	彭永东		23	38	3.0	5.0
7	郭敏		8	4	2.0	2.0
8	牛迪		2	0	0.0	0.0
9	刘艳军		2	0	0.0	0.0