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摘要:
[目的]克隆吡咯伯克霍尔德氏菌JK-SH007(Burkholderia pyrrocinia JK-SH007)多聚半乳糖醛酸酶基因(Bp-PG),并阐明BpPG基因在B.pyrrocinia JK-SH007定殖中的生物学功能.[方法]通过设计特异性引物(PG-F、PG-F)克隆BpPG基因,并对其全长基因进行生物信息学分析;采用MEGA 5.0软件进行系统发育树分析;将B.pyrrocinia JK-SH007接种杨树,利用实时荧光定量PCR方法,分析BpPG基因在B.pyrrocinia JK-SH007定殖过程中的差异表达.[结果]BpPG基因全长2001 bp,编码666个氨基酸,预测蛋白质分子量69.23 ku,理论等电点为8.37;BpPG蛋白有6个蛋白质结合位点,属于Glycosyl hydrolases family 28家族,为亲水性蛋白,不具有信号肽.二级结构主要包括α-螺旋、β折叠、延伸链和无规则卷曲,三级结构预测结果与二级结构相符.系统进化分析表明,BpPG与PG(GenBank序列号WP 034181566.1)具有同源性.实时荧光定量PCR结果显示B.pyrrocinia JK-SH007定殖过程中,不同时期的BpPG基因表达量存在差异.[结论]克隆得到BpPG基因,BpPG基因在进化上是保守的,其极有可能在B.pyrrocinia JK-SH007定殖过程中发挥作用.
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文献信息
篇名 吡咯伯克霍尔德氏菌JK-SH007多聚半乳糖醛酸酶基因的克隆及表达分析
来源期刊 南京林业大学学报(自然科学版) 学科 农学
关键词 吡咯伯克霍尔德氏菌 多聚半乳糖醛酸酶基因 分子克隆 表达分析
年,卷(期) 2018,(4) 所属期刊栏目 研究论文
研究方向 页码范围 127-133
页数 7页 分类号 Q939.96|S763.1
字数 语种 中文
DOI 10.3969/j.issn.1000-2006.201708013
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作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 叶建仁 7 68 3.0 7.0
2 黄金思 2 1 1.0 1.0
3 陈飞飞 1 1 1.0 1.0
4 王翕韫 1 1 1.0 1.0
5 刘婉慧 1 1 1.0 1.0
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节点文献
吡咯伯克霍尔德氏菌
多聚半乳糖醛酸酶基因
分子克隆
表达分析
研究起点
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相关学者/机构
期刊影响力
南京林业大学学报(自然科学版)
双月刊
1000-2006
32-1161/S
大16开
南京市龙蟠路159号南京林业大学
28-16
1958
chi
出版文献量(篇)
4299
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8
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