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吡咯伯克霍尔德氏菌JK-SH007多聚半乳糖醛酸酶基因的克隆及表达分析
吡咯伯克霍尔德氏菌JK-SH007多聚半乳糖醛酸酶基因的克隆及表达分析
作者:
刘婉慧
叶建仁
王翕韫
陈飞飞
黄金思
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
吡咯伯克霍尔德氏菌
多聚半乳糖醛酸酶基因
分子克隆
表达分析
摘要:
[目的]克隆吡咯伯克霍尔德氏菌JK-SH007(Burkholderia pyrrocinia JK-SH007)多聚半乳糖醛酸酶基因(Bp-PG),并阐明BpPG基因在B.pyrrocinia JK-SH007定殖中的生物学功能.[方法]通过设计特异性引物(PG-F、PG-F)克隆BpPG基因,并对其全长基因进行生物信息学分析;采用MEGA 5.0软件进行系统发育树分析;将B.pyrrocinia JK-SH007接种杨树,利用实时荧光定量PCR方法,分析BpPG基因在B.pyrrocinia JK-SH007定殖过程中的差异表达.[结果]BpPG基因全长2001 bp,编码666个氨基酸,预测蛋白质分子量69.23 ku,理论等电点为8.37;BpPG蛋白有6个蛋白质结合位点,属于Glycosyl hydrolases family 28家族,为亲水性蛋白,不具有信号肽.二级结构主要包括α-螺旋、β折叠、延伸链和无规则卷曲,三级结构预测结果与二级结构相符.系统进化分析表明,BpPG与PG(GenBank序列号WP 034181566.1)具有同源性.实时荧光定量PCR结果显示B.pyrrocinia JK-SH007定殖过程中,不同时期的BpPG基因表达量存在差异.[结论]克隆得到BpPG基因,BpPG基因在进化上是保守的,其极有可能在B.pyrrocinia JK-SH007定殖过程中发挥作用.
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内容分析
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文献信息
篇名
吡咯伯克霍尔德氏菌JK-SH007多聚半乳糖醛酸酶基因的克隆及表达分析
来源期刊
南京林业大学学报(自然科学版)
学科
农学
关键词
吡咯伯克霍尔德氏菌
多聚半乳糖醛酸酶基因
分子克隆
表达分析
年,卷(期)
2018,(4)
所属期刊栏目
研究论文
研究方向
页码范围
127-133
页数
7页
分类号
Q939.96|S763.1
字数
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1000-2006.201708013
五维指标
作者信息
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单位
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叶建仁
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黄金思
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陈飞飞
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王翕韫
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刘婉慧
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多聚半乳糖醛酸酶基因
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期刊影响力
南京林业大学学报(自然科学版)
主办单位:
南京林业大学
出版周期:
双月刊
ISSN:
1000-2006
CN:
32-1161/S
开本:
大16开
出版地:
南京市龙蟠路159号南京林业大学
邮发代号:
28-16
创刊时间:
1958
语种:
chi
出版文献量(篇)
4299
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8
总被引数(次)
67156
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南京林业大学学报(自然科学版)2001
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南京林业大学学报(自然科学版)1999
南京林业大学学报(自然科学版)1998
南京林业大学学报(自然科学版)2018年第6期
南京林业大学学报(自然科学版)2018年第5期
南京林业大学学报(自然科学版)2018年第4期
南京林业大学学报(自然科学版)2018年第3期
南京林业大学学报(自然科学版)2018年第2期
南京林业大学学报(自然科学版)2018年第1期
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