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利用epiCRISPR载体表达双sgRNA实现高效的HDAC基因编辑
利用epiCRISPR载体表达双sgRNA实现高效的HDAC基因编辑
作者:
李苗苗
王子实
王永明
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
CRISPR/Cas9
基因敲除
epiCRISPR
双gRNA
组蛋白去乙酰化酶
纯合敲除致死基因
摘要:
CRISPR/Cas9技术是广泛使用的一种基因编辑技术,它包括Cas9和gRNA 2个元件.具有内切酶活性的Cas9能够通过gRNA识别并切断目标DNA序列.细胞主要通过非同源末端连接途径修复DNA,这是一个容易产生indel的修复途径,理论上有近2/3概率产生移码突变,可以用于基因敲除.很多癌缅胞系和体外培养的细胞系基因拷贝数增加了,同时敲除所有拷贝的难度增大,因此有必要开发一种高效的基因敲除方法.本实验室在前期工作中利用附着体载体表达的Cas9和gRNA,可以高效地产生indel,称为epiCRISPR系统.在本研究中,我们用epiCRISPR系统同时表达2个gRNA,可以在目标基因上删除一段DNA序列,其长度不是3的倍数,这样可以高效地产生移码突变.HDAC(histone deacetylase)基因家族编码一类负责组蛋白去乙酰化的蛋白酶,对细胞生长有重要影响,敲除难度较大.我们利用附着体载体表达双gRNA的技术成功地得到了HDAC1、HDAC2和HDAC6纯合敲除细胞系.
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棉花
CRISPR/Cas9
编辑效率
脱靶效率
sgRNA类型
内容分析
文献信息
引文网络
相关学者/机构
相关基金
期刊文献
内容分析
关键词云
关键词热度
相关文献总数
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(/年)
文献信息
篇名
利用epiCRISPR载体表达双sgRNA实现高效的HDAC基因编辑
来源期刊
复旦学报(自然科学版)
学科
生物学
关键词
CRISPR/Cas9
基因敲除
epiCRISPR
双gRNA
组蛋白去乙酰化酶
纯合敲除致死基因
年,卷(期)
2018,(4)
所属期刊栏目
研究方向
页码范围
412-421
页数
10页
分类号
Q812
字数
语种
中文
DOI
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
王子实
复旦大学生命科学学院
1
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0.0
0.0
2
李苗苗
复旦大学生命科学学院
5
3
1.0
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王永明
复旦大学生命科学学院
3
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1.0
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研究主题发展历程
节点文献
CRISPR/Cas9
基因敲除
epiCRISPR
双gRNA
组蛋白去乙酰化酶
纯合敲除致死基因
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
复旦学报(自然科学版)
主办单位:
复旦大学
出版周期:
双月刊
ISSN:
0427-7104
CN:
31-1330/N
开本:
16开
出版地:
上海市邯郸路220号
邮发代号:
4-193
创刊时间:
1955
语种:
chi
出版文献量(篇)
2978
总下载数(次)
5
总被引数(次)
22578
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
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