利用CRISPR/Cas9全基因组文库筛选HCT116细胞增殖相关基因

• 作者: 付汉江 潘冰心 郑晓飞
• 来源期刊: 军事医学
• 学科: 生物学
• 关键词: CRISPR/Cas9全基因组文库 高通量测序 细胞增殖 基因组 HCT 116细胞 微RNA
• 年，卷（期）: 2018,（11）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 822-827
• 页数: 6页
• 分类号: Q78
• 字数: 4814字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7644/j.issn.1674-9960.2018.11.006

摘要

目的 利用CRISPR/Cas9全基因组文库大规模筛选与细胞增殖相关的基因.方法 将HCT 116细胞大规模培养至1 ×108个,将CRISPR/Cas9全基因组慢病毒文库大规模感染,加入嘌呤霉素筛选6d后收集部分细胞,剩余细胞继续培养10d,收取全部细胞,提取基因组DNA,扩增单链向导RNA (sgRNA)序列、建库并进行深度测序,比较前后两组sgRNA序列数据,根据sgRNA序列数量筛选出与细胞增殖相关的基因.结果 与结论 筛选出了一批与HCT 116细胞增殖相关的蛋白编码基因及miRNA基因,获得了增殖相关miRNA及其靶基因的调控网络,为进一步验证分析这些基因在HCT 116细胞中的功能奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	付汉江	安徽医科大学研究生院	9	0	0.0	0.0
3	郑晓飞	安徽医科大学研究生院	7	0	0.0	0.0
5	潘冰心	安徽医科大学研究生院	1	0	0.0	0.0