火龙果HuABAR的克隆、生物信息学分析及亚细胞定位

• 作者: 文晓鹏 李慧平 汤纬玮 王庆竹
• 来源期刊: 华中师范大学学报（自然科学版）
• 学科: 农学
• 关键词: 火龙果 非生物胁迫 脱落酸受体基因 生物信息学分析 亚细胞定位
• 年，卷（期）: 2018,（5）
• 所属期刊栏目: 园艺·林学
• 页码范围: 18-24
• 页数: 7页
• 分类号: S667.903.2
• 字数: 4724字
• 语种: 中文

摘要

在前期利用SSH筛选到抗旱相关基因HuABAR的Unigene序列的基础上,进行了HuABAR的全长cDNA克隆、生物信息学分析及亚细胞定位.结果表明:HuABAR基因cDNA全长为1239 bp,5′-UTR为264 bp,3′-UTR为414 bp,完整开放阅读框(ORF)共561 bp,编码187个氨基酸;生物信息学分析显示,HuA-BAR基因编码蛋白具有典型的SRPBCC结构域,并与PYR1/PYLs(pyrabactin resistance 1/PYR1 like)家族具有较高的相似性;HuABAR在干旱、高温(42℃)和低温(4℃)等逆境胁迫下显著上调表达,并在干旱胁迫5 d、高温3 d时表达量最高,低温处理5 d内,表达量持续上升;通过PEG介导法瞬时转化拟南芥原生质体进行亚细胞定位分析,发现该基因定位于细胞质,与已报道的其他PYR1/PYLs家族基因一致.因此,HuABAR基因可能在火龙果干旱胁迫应答中发挥重要作用.