胡黄连GPPS基因的生物信息学分析

• 作者: 丁卫凯 周延清 朱彦秋 李娇娇 段红英 王慧娜 郑雪
• 来源期刊: 河南农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 胡黄连 GPPS基因 生物信息学 萜类物质
• 年，卷（期）: 2018,（6）
• 所属期刊栏目: 园艺
• 页码范围: 104-110
• 页数: 7页
• 分类号: S567
• 字数: 3647字
• 语种: 中文
• DOI: 10.15933/j.cnki.1004-3268.2018.06.018

摘要

为了解胡黄连GPPS基因及其编码蛋白的生物学特性,并推测其功能,综合运用DNAMAN、MEGA6、Blast、Blastp和TMHMM Server等软件,分析了胡黄连GPPS基因序列及其编码蛋白的理化性质、结构域等,并对部分高等植物GPPS蛋白序列进行了比对和进化树构建.结果表明,胡黄连GPPS基因包含一个1 116 bp的开放阅读框(ORF),共编码371个氨基酸,编码蛋白为亲水性蛋白,很可能定位于叶绿体上,定位系数为6;金鱼草、小花茉莉GPPS基因编码蛋白与该蛋白相似度较高,分别为74％和77％.此外,空间结构分析和序列比对结果都表明,胡黄连GPPS基因编码蛋白与类异戊二烯合酶蛋白具有较高的相似度,推测胡黄连GPPS基因为植物萜类合成途径组分之一.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	周延清	河南师范大学生命科学学院	85	1261	15.0	33.0
2	段红英	河南师范大学生命科学学院	45	382	11.0	16.0
3	王慧娜	河南师范大学生命科学学院	3	4	1.0	1.0
4	郑雪	河南师范大学生命科学学院	2	2	1.0	1.0
5	朱彦秋	河南师范大学生命科学学院	1	2	1.0	1.0
6	丁卫凯	河南师范大学生命科学学院	1	2	1.0	1.0
7	李娇娇	河南师范大学生命科学学院	6	2	1.0	1.0