橡胶灵芝菌(Ganoderma pseudoferreum)DNA条形码检测筛选

• 作者: 孙爱花 安泽伟 李维国 涂敏 程汉 胡彦师 蔡海滨
• 来源期刊: 热带作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 橡胶灵芝菌 鉴定 DNA条形码 ITS
• 年，卷（期）: 2018,（11）
• 所属期刊栏目: 植物病理、作物病虫害及其防治
• 页码范围: 2225-2234
• 页数: 10页
• 分类号: S763.7
• 字数: 691字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2018.11.017

摘要

选用10对DNA条形码标准序列ITS、COI、nrDNA-LSU、nrDNA-SSU和trnL DNA对海南和云南红根病区分离的21个橡胶灵芝菌进行检测.除COI和trnL DNA外,其他8对引物均扩增得到PCR产物,产物大小范围为268～1355bp,种内相似度为98.05％～99.54％.分别将扩增得到的序列与GenBank公布上的Ganoderma属和常见真菌属序列,共77个ITS、74个nrDNA-LSU和74个nrDNA-SSU序列进行系统进化树构建与分析.结果表明:nrDNA-LSU序列和nrDNA-SSU序列种间差异较小,不能准确区分Ganoderma属及其他属;5对ITS序列均能区分Ganoderma属,但仅ITS1/ITS4序列能将Ganoderma属下16个种归入不同分支.ITS1/ITS4序列表现出适宜的种内与种间差异,适宜作为G.pseudoferreum的DNA条形码.