鹅掌楸属GST家族基因的克隆与表达分析

• 作者: 司卫杰 成彦丽 朱腾飞 李火根 王曦
• 来源期刊: 西北植物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 鹅掌楸属 GST 克隆 序列分析 表达
• 年，卷（期）: 2018,（3）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 445-455
• 页数: 11页
• 分类号: Q785|Q786
• 字数: 6971字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7606/j.issn.1000-4025.2018.03.0445

摘要

该研究以鹅掌楸属植物为试验材料,在北美鹅掌楸和鹅掌楸转录组数据库中筛选出54条GST基因家族的EST序列,通过比对将其归为Tau、Zeta、Theta和Phi等4个亚类.在这4个亚类中各选取1条EST序列设计引物,通过反转录PCR (RT-PCR)与cDNA末端快速扩增(RACE)技术,从鹅掌楸属植物中克隆出4条全长分别为1 150、932、1 022和1 067 bp的基因,并分别命名为LtGS Tpa rCb、LtGSTZ-like、LtGSTF13a和LcGSTT1.对LtGSTparCb、LtGSTZ-like、LtGSTF13a和LcGSTT1这4个基因编码蛋白质的结构预测发现,其蛋白质的分子质量分别为25.17、25.34、24.49和28.09 kD;理论等电点分别是5.60、6.53、6.66和9.20,即LtGSTparCb、LtGSTZ-like、LtGSTF13a蛋白质属于酸性蛋白,LcGSTT1属于碱性蛋白;不稳定系数分别是33.01、36.97、43.19和47.96,即LtGSTparCb、LtGSTZ-like为稳定蛋白,LtGSTF13a、LcGSTT1为不稳定蛋白;α-螺旋(alpha helix)是这4个蛋白质二级结构的主要成分.利用在线软件TargetP并结合GST蛋白质在其他植物中亚细胞定位的结果,推测这4种蛋白质极有可能位于鹅掌楸属植物的细胞质内.实时荧光定量PCR分析结果表明,这4个基因在北美鹅掌楸各个组织中均有表达,其中LtGSTparCb和LtGS TF 13a在叶中的表达量最高,在其他组织中的表达量均较低;LtGSTZ-like在花器官中的表达量最高,在叶中的表达量最低,在其他组织中的表达量居于两者之间;LcGSTT1在叶中表达量最高,花器官中表达量其次,在茎和叶芽中的表达量偏低.该研究结果可为鹅掌楸属GST家族基因的功能研究奠定基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李火根	南京林业大学南方现代林业协同创新中心	61	695	15.0	24.0
2	成彦丽	南京林业大学南方现代林业协同创新中心	3	1	1.0	1.0
3	王曦	南京林业大学南方现代林业协同创新中心	3	2	1.0	1.0
4	司卫杰	南京林业大学南方现代林业协同创新中心	1	1	1.0	1.0
5	朱腾飞	南京林业大学南方现代林业协同创新中心	1	1	1.0	1.0