基于Laplacian正则化与双向随机游走的药物重定位方法

• 作者: 宋映龙 彭昱忠
• 来源期刊: 计算机应用与软件
• 学科: 工学
• 关键词: 药物重定位 随机游走 Laplacian正则化 LN-RWR
• 年，卷（期）: 2018,（7）
• 所属期刊栏目: 多媒体技术应用
• 页码范围: 199-204,249
• 页数: 7页
• 分类号: TP3
• 字数: 4761字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-386x.2018.07.036

摘要

传统的药物研制需要企业投入大量的人力物力和研发时间,而且要承担很高的失败风险.药物重定位可以为已有药物寻找新的适应症,极大地降低成本、提高研发效率,因此受到广泛重视.随着大规模生物表型数据的收集,基于计算方法的药物重定位表现出很大的潜力,其计算结果可以为生物学实验提供重要的方向性意见,所以研究优秀的药物重定位方法非常重要.提出LN-RWR算法,整合药物之间与疾病之间的相似度信息、药物和疾病的互作用信息构建异质网络,使用Laplacian正则化构造转移矩阵,在异质网路上进行随机游走,综合双向随机游走的结果进行药物重定位.实验结果表明,LN-RWR比现有方法效果更好,在不同数据集上都达到了较好的效果,而且案例分析结果表明LN-RWR的预测结果很多正在被生物学家们关注和研究.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	彭昱忠	复旦大学计算机科学技术学院上海市智能信息处理重点实验室	35	235	9.0	14.0
5	宋映龙	复旦大学计算机科学技术学院上海市智能信息处理重点实验室	1	2	1.0	1.0