黄花大苞姜花药发育qRT?PCR内参基因筛选

• 作者: 张俊平 王英强
• 来源期刊: 广西植物
• 学科: 生物学
• 关键词: 黄花大苞姜 花药 内参基因 qRT-PCR BestKeeper geNorm Normfinder
• 年，卷（期）: 2018,（1）
• 所属期刊栏目: 植物生理与分子生物学
• 页码范围: 76-83
• 页数: 8页
• 分类号: Q943.2
• 字数: 4615字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11931/guihaia.gxzw201702014

摘要

qRT-PCR技术具有定量准确、灵敏度高、重复性好等特点,被广泛用于基因表达分析.内参基因的稳定性对于准确分析实验结果非常重要.该研究以黄花大苞姜(Caulokaempferia coenobialis)花粉母细胞时期(PMC)、四分体时期(TET)、成熟花粉时期(MP)的花药组织为材料,基于3个阶段花药转录组表达谱数据以及常用传统内参基因,筛选出Glyceraldehyde 3?phosphate dehydrogenase(GAPDH)、Malate dehydrogenase (MDH)、α?tubulin3(TUA3)、β?tubulin7(TUB7)和Actin6(ACT6)作为候选内参基因,进行qRT-PCR分析;并运用BestKeeper、geNorm和Normfinder软件综合分析5个候选内参基因在黄花大苞姜花药发育过程中的表达稳定性.结果表明:MDH和TUB7的表达最稳定,ACT6的稳定性最差;分别以MDH和TUB7作为内参,分析GBE1在黄花大苞姜花药发育中的表达模式,并与该基因在花药转录组中的表达模式做相关系数分析,3种表达模式结果一致,进一步验证了MDH和TUB7的表达稳定性.这说明MDH和TUB7适合作为qRT-PCR分析黄花大苞姜花药发育过程中相关基因表达模式的内参基因.该研究结果为黄花大苞姜花药发育分子机制相关研究奠定了基础,也为姜科花药发育相关内参基因的选择提供了参考.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王英强	华南师范大学生命科学学院广东省植物发育生物工程重点实验室	5	18	2.0	4.0
5	张俊平	华南师范大学生命科学学院广东省植物发育生物工程重点实验室	1	0	0.0	0.0