中国樱桃实时定量PCR(qRT-PCR)内参基因的筛选与鉴定

• 作者: 张弘 朱友银 李永强 王月 邵姁 郭卫东
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 关键词: 中国樱桃 转录组 内参基因 实时定量PCR(qRT-PCR)
• 年，卷（期）: 2015,（5）
• 所属期刊栏目: 研究资源与技术改进
• 页码范围: 690-700
• 页数: 11页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2015.05.015

摘要

中国樱桃(Prunus pseudocerasus)是一种重要的落叶果树,为了丰富稳定可靠的内参基因,提高实时定量PCR(quantitative Real-time PCR,qRT-PCR)分析中国樱桃基因表达的准确性,本研究在分析中国樱桃花芽转录组数据的基础上,筛选了表达稳定的微管蛋白(tubulin,TUB)、β肌动蛋自(β-actin,ACTB)、甘油醛-3-磷酸-脱氢酶(glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase,GAPDH)、延伸因子1β(elongation factor 1β,EF1B)、泛素接合酶(ubiquitin-conjugating enzyme,UBCE)、18S rRNA和翻译起始因子5A(translation initiation factor 5A,TIF5A)7个看家基因,分别利用Genorm、Bestkeeper、NormFinder和Delta Ct等计算方法分析了上述基因在4℃、NaCl(300 mmol/L)和脱落酸(ABA)(100 mmol/L)处理下以及低温诱导花芽休眠解除过程中的表达稳定性.综合分析结果表明,GAPDH在4℃和NaCl处理下最稳定,而ACTB和UBCE分别在ABA处理和花芽休眠解除过程中最稳定,说明GAPDH可以作为中国樱桃低温响应和盐碱胁迫处理的内参基因,ACTB和UBCE可以作为ABA处理和花芽休眠解除过程中的内参基因.本研究结果为研究中国樱桃不同生理过程中目的基因表达提供了稳定可靠的内参基因,具有重要参考价值.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郭卫东		70	884	16.0	27.0
2	李永强	浙江师范大学浙江省特色经济植物生物技术研究重点实验室	20	221	7.0	14.0
3	朱友银	金华职业技术学院农业与生物工程学院	8	27	2.0	5.0
7	王月	浙江师范大学浙江省特色经济植物生物技术研究重点实验室	3	19	1.0	3.0
8	张弘	浙江师范大学浙江省特色经济植物生物技术研究重点实验室	1	17	1.0	1.0
9	邵姁	浙江师范大学浙江省特色经济植物生物技术研究重点实验室	2	18	1.0	2.0