基于全基因组的卷柏复苏相关AP2/ERF转录因子基因家族分析

• 作者: 宋经元 徐志超 浦香东
• 来源期刊: 中国现代中药
• 关键词: 卷柏 复苏植物 AP2/ERF转录因子 DREB
• 年，卷（期）: 2018,（5）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 516-521
• 页数: 6页
• 字数: 2927字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13313/j.issn.1673-4890.20180312002

摘要

目的:系统解析药用植物卷柏AP2/ERF(APETALA2/Ethylene Responsive Factor)转录因子家族成员,为卷柏复苏相关分子调控机制研究奠定基础.方法:基于卷柏全基因组数据,采用BLASTP序列比对、系统发育树构建、基因表达分析等方法筛选卷柏复苏相关候选AP2/ERF转录因子基因.结果:卷柏基因组共注释到68个AP2/ERF家族,数量远少于已报道的高等植物;系统进化分析将AP2/ERF分为AP2(23)、DREB(16)、ERF(18)、RAV(8)和SOLOIST(3)亚家族,AP2/ERF结构域高度保守;17个基因与卷柏干旱及复水表型显著正相关,包括7个DREB亚家族和6个ERF亚家族成员.结论:AP2/ERF转录因子的挖掘为复苏相关的功能鉴定及分子调控机制研究提供基础.