无创性免核酸提取的多重SNP基因分型技术

• 作者: 周军 赵亚玲 赵烨 郑直
• 来源期刊: 基础医学与临床
• 学科: 医学
• 关键词: 无创性样品 核酸提取 SNP基因分型
• 年，卷（期）: 2018,（11）
• 所属期刊栏目: 技术与方法
• 页码范围: 1577-1582
• 页数: 6页
• 分类号: R331
• 字数: 3021字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-6325.2018.11.015

摘要

目的 介绍一种无创性免核酸提取的样品前处理方法 ,结合高通量基因分型技术,为大规模流行病学监测及遗传学分析提供新的技术手段.方法无需核酸提取,直接裂解唾液或口腔拭子样品,加入带有通用尾部序列的多个寡核苷酸特异探针,通过夹心杂交将样品中的靶DNA捕获到96孔板中,利用基于延伸连接的多重探针扩增(MELPA)技术及核酸飞行质谱(MassARRAY)实现多重单碱基突变(SNP)检测.以具有抗疟药物(伯氨喹)诱导溶血风险的葡萄糖-6-磷酸脱氢酶(G6PD)的23个SNP突变检测作为应用对象,测试唾液样品的反应条件.通过与商业化SNP测定的基于核酸飞行质谱的多重SNP分型技术(iPLEX)进行比较,评估该方法的准确性,重复性和可靠性.结果 本方法可成功的对G6PD的23个SNP进行分型,40μL唾液或1个口腔拭子样本足够进行2个检测.36 h内(手工操作时间约2 h)可完成384个样品检测分析.其检测结果与测序结果一致,重复性较好,可靠性高,准确度优于传统的以血液为样品的iPLEX方法.结论 建立了适用于高通量的无创性免核酸提取的多重SNP基因分型技术,为大规模基因分型筛查提供了一个高效、准确的方法.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郑直	中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院生物化学与分子生物学系	11	11	2.0	3.0
2	赵亚玲	中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院生物化学与分子生物学系	2	0	0.0	0.0
3	赵烨	中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院生物化学与分子生物学系	1	0	0.0	0.0
4	周军	中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院生物化学与分子生物学系	1	0	0.0	0.0