基于RNA-seq技术分析意大利蜜蜂幼虫肠道响应球囊菌胁迫的高表达基因

• 作者: 刘敏 张瞾楠 徐细建 梁勤 熊翠玲 郭睿 陈大福 骆群 黄枳腱
• 来源期刊: 江苏农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: RNA seq 意大利蜜蜂 幼虫肠道 高表达基因
• 年，卷（期）: 2018,（13）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 29-35
• 页数: 7页
• 分类号: S893.3
• 字数: 7116字
• 语种: 中文
• DOI: 10.15889/j.issn.1002-1302.2018.13.007

摘要

对意蜂幼虫肠道组织基因进行深度RNA测序,并对高表达基因进行GO注释和KEGG分析,旨在揭示意蜂幼虫免疫抗病机制.分别取3、4、5、6日龄意蜂幼虫中肠组织抽提RNA,合成cDNA.得到的总读段数都在26 715 638条以上,有效数据达到97％以上,且测序饱和度良好,说明测序所得数据真实可信.将测序有效数据和意蜂公布DNA数据库进行比对,发现意蜂幼虫肠道中有13 789个基因有不同程度表达.选取各样本FPKM排序最前且表达水平最高的100个基因进行GO注释,这里主要涉及细胞组分、分子功能和生物学进程功能分析.利用KEGG分析显示这100个高表达基因分布在能量代谢、翻译、组装和降解以及信号转导等多条通路上.初步分析相应共有基因和特有基因在相关通路上的作用,并对意蜂幼虫肠道受球囊菌胁迫后的相关免疫机制进行一定分析.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈大福	福建农林大学蜂学学院	47	227	8.0	12.0
2	梁勤	福建农林大学蜂学学院	53	286	9.0	13.0
3	熊翠玲	福建农林大学蜂学学院	17	53	4.0	6.0
4	徐细建	福建农林大学蜂学学院	6	23	2.0	4.0
5	黄枳腱	福建农林大学蜂学学院	4	19	2.0	4.0
6	刘敏	福建农林大学蜂学学院	9	69	4.0	8.0
7	骆群		7	19	1.0	4.0
8	张瞾楠	福建农林大学蜂学学院	1	0	0.0	0.0