基于弱监督的蛋白质交互识别

• 作者: 彭昀磊 牛耘
• 来源期刊: 计算机技术与发展
• 学科: 工学
• 关键词: 蛋白质交互 弱监督 聚类 模式
• 年，卷（期）: 2018,（2）
• 所属期刊栏目: 智能、算法、系统工程
• 页码范围: 19-23
• 页数: 5页
• 分类号: TP391
• 字数: 4658字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1673-629X.2018.02.005

摘要

蛋白质交互信息是解决大量医学难题的关键信息,这些信息都记录在医学文献中,随着生物医学文献的大量增加,以手工收集信息的方式已经难以满足实际需求.对此,提出一种基于弱监督的方法识别文本中的蛋白质交互关系.该方法首先根据文本库产生蛋白质交互的向量表示;接着根据蛋白质对实例的相似性对实例聚类,产生提取模式;然后根据提取模式从文本库中找到新的满足条件的蛋白质对实例,作为候选实例;最后对候选实例对应的蛋白质对进行评估,并将满足条件的蛋白质对添加到种子集合中.该方法仅需少量的蛋白质对作为种子,通过迭代算法不断扩充种子集,可以使得监督最小化,极大地减少了人工干预.实验结果表明,该方法取得了较高的精度和召回率.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	牛耘	南京航空航天大学计算机科学与技术学院	24	86	5.0	8.0
2	彭昀磊	南京航空航天大学计算机科学与技术学院	2	5	1.0	2.0