陆川猪FTO基因的克隆及生物信息学分析

• 作者: 吴永文 夏琴 崔悦悦 瞿秋红 蒋钦杨 邹辉 黄艳娜
• 来源期刊: 黑龙江畜牧兽医（上半月）
• 学科: 农学
• 关键词: 陆川猪 FTO 基因 克隆 软件 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2018,（10）
• 所属期刊栏目: 试验研究
• 页码范围: 1-5,239
• 页数: 6页
• 分类号: S828|Q785
• 语种: 中文
• DOI: 10.13881/j.cnki.hljxmsy.2018.02.0175

摘要

为了获得广西陆川猪肥胖相关基因(FTO)编码区序列(CDS),试验利用基因克隆技术,从陆川猪背最长肌组织中提取总RNA,扩增出FTO基因CDS,并运用Lasergene 7.0、ExPASy ProtParam、ExPASy ProtScale、NPS@在线蛋白分析系统和SWISS-MODEL在线分析预测系统等分析软件对扩增出的序列进行生物信息学分析.结果表明:通过克隆测序得到的陆川猪FTO基因CDS全长为1 518 bp,与GenBank中公布的乌金猪FTO基因CDS的同源性为99.9％,与苏钟猪FTO基因CDS的同源性为99.6％;陆川猪存在第1 050位点的C→G,碱基G为陆川猪所特有,导致天冬氨酸突变为谷氨酸;通过建立系统进化树发现,陆川猪与乌金猪的遗传距离最近,它们聚为一支;陆川猪FTO氨基酸组成中亮氨酸含量最高,占总氨基酸的比例为11.7％,FTO蛋白具有较强的亲水性;陆川猪FTO蛋白的二级、三级结构预测显示包含α-螺旋、无规则卷曲和延伸链.说明陆川猪FTO基因具有高度的保守性,今后在陆川猪脂肪沉积研究中,FTO基因可作为主要候选基因之一.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	黄艳娜		31	58	5.0	6.0
2	蒋钦杨		97	256	8.0	12.0
3	邹辉		11	1	1.0	1.0
4	崔悦悦		9	1	1.0	1.0
5	夏琴		13	1	1.0	1.0
6	瞿秋红		13	4	1.0	2.0
7	吴永文		1	0	0.0	0.0