杜仲脂氧合酶基因家族全基因组鉴定及其表达特性研究

• 作者: 何凤 庆军 朱利利 杜庆鑫 杜红岩
• 来源期刊: 植物研究
• 学科: 农学
• 关键词: 杜仲 LOX基因家族 生物信息学 基因功能
• 年，卷（期）: 2019,（6）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 927-934
• 页数: 8页
• 分类号: S722.3
• 字数: 4714字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7525/j.issn.1673-5102.2019.06.016

摘要

LOX(脂氧合酶)是动、植物中普遍存在的一种氧合酶,在植物的生长发育和逆境胁迫中发挥重要作用.本研究在杜仲基因组范围内,利用生物信息学方法对LOX基因家族进行全面鉴定,并分析了其基因结构、定位及其所编码蛋白质的理化性质、结构特征、分类和功能等.结果 显示:杜仲LOX基因家族有23条LOX基因序列,分别定位于细胞质或叶绿体中,分为9-LOX和13-LOX两个亚家族,其中9-LOX类型仅包含一个,13-LOX类型包含22个;23个LOX基因非平均分布于12条scaffolds上,一些基因发生串联分布;RNA-Seq表达结果显示6个13-LOX类型基因在杜仲叶、果、树皮和种仁中几乎没有表达,而其他17个LOX基因表达具有组织和时空表达特异性.研究结果为揭示杜仲LOX基因家族成员的功能提供重要线索,为进一步研究LOX基因家族提供理论基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杜庆鑫	中国林业科学研究院经济林研究开发中心	11	40	4.0	6.0
3	朱利利	中国林业科学研究院经济林研究开发中心	5	7	1.0	2.0
7	庆军	中国林业科学研究院经济林研究开发中心	7	6	2.0	2.0
13	何凤	中国林业科学研究院经济林研究开发中心	2	0	0.0	0.0