大豆bHLH转录因子家族成员的进化及功能分化研究

• 作者: 付觉民 代幸龙 刘旭阳 姚远 徐月霞 曲骁冲 洪一峰 程琳 董沛峰 薛亚杰 赵基海
• 来源期刊: 信阳师范学院学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 大豆 bHLH 转录因子 系统发育分析 表达分析
• 年，卷（期）: 2019,（1）
• 所属期刊栏目: 基础理论研究
• 页码范围: 27-38
• 页数: 12页
• 分类号: Q941
• 字数: 5062字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1003-0972.2019.01.006

摘要

碱性螺旋-环-螺旋蛋白(basic Helix-Loop-Hleix,bHLH)转录因子家族是动植物中最大的转录因子家族之一,主要由碱性氨基酸区域和螺旋-环-螺旋区域组成,在动植物生长发育和胁迫应答反应中发挥着重要作用.本研究通过对大豆全基因组生物信息学分析和分子生物学研究手段,深入研究了大豆bHLH基因家族的进化机制,同时探讨了该基因家族在大豆中的功能分化.结果表明,大豆中含有340个非冗余的bHLH基因家族成员,通过对这些成员的Pfam蛋白结构域、Motif组成和系统进化关系的分析,将这些成员分为15组共24个亚家族,在大豆20条染色体上呈现不均匀分布.bHLH理化性质差异较大,编码的大豆氨基酸数量为91～815 aa,相对分子量为10 273.88～91 300.38,理论等电点为4.56～10.40;碱性氨基酸区含有His5-Glu9-Arg13保守序列,与靶基因结合有关,HLH区含有Arg23和Arg55,与形成二聚体有关,同时含有5种保守元件.多数成员在大豆根以及花发育的5个时期中具有组织表达特异性,不同基因表达量差异较大.