西洋参bHLH转录因子家族生物信息学分析

• 作者: 周珂辉 李纪冬 王希 邸鹏 闫艳 韩鹏
• 来源期刊: 吉林农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 西洋参 bHLH基因家族 生物信息学方法 生物合成途径
• 年，卷（期）: 2019,（3）
• 页码范围: 316-323
• 页数: 8页
• 分类号: S567.53|Q78
• 语种: 中文
• DOI: 10.13327/j.jjlau.2019.4723

摘要

bHLH是真核生物中一类编码转录调控因子的基因家族,在植物生长发育中具有重要的调控作用.通过对西洋参根、叶、花蕾样品进行转录组测序,筛选其中的bHLH家族基因,利用生物信息学方法对筛选到的基因进行表达模式、蛋白结构、细胞定位及系统进化分析.结果显示:从西洋参转录组中共鉴定得到62个西洋参bHLH家族基因,这些bHLH在根、叶、花蕾中具有4种表达模式.西洋参bHLH亚细胞定位预测主要在细胞核内,所有表达产物均包含HLH结构域.进化分析显示,西洋参中62个bHLH基因可分为18个亚类,其中第Ⅺ亚族中包含最多的bHLH成员,共包含11个bHLH蛋白;第Ⅲf、Ⅳa、Ⅲ(a+c)、Ⅰb(2)、Orphans、Ⅳb亚族中的成员数量均为1个,其他亚族为2～9个.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王希		10	14	2.0	3.0
2	闫艳	吉林农业大学中药材学院	2	0	0.0	0.0
3	周珂辉	吉林农业大学中药材学院	1	0	0.0	0.0
4	李纪冬	吉林农业大学中药材学院	1	0	0.0	0.0
5	韩鹏	吉林农业大学中药材学院	7	16	2.0	3.0
6	邸鹏	吉林农业大学中药材学院	3	11	2.0	3.0