芒果果实bHLH家族转录因子的生物信息学分析

• 作者: 刘恒 文定青 武红霞 王松标 赵巧丽 邹明宏 郑斌
• 来源期刊: 热带作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 芒果 bHLH家族 转录因子 生物信息学
• 年，卷（期）: 2019,（2）
• 所属期刊栏目: 生物技术与组织培养
• 页码范围: 289-299
• 页数: 11页
• 分类号: S667.7
• 字数: 5097字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2019.02.012

摘要

bHLH家族作为植物中较大的转录因子家族之一,在真核生物生长发育调控中具有重要作用.本研究基于芒果果实转录组数据,利用生物信息学方法鉴定出87个bHLH家族蛋白,其中酸性蛋白所占比例较大,大部分为不稳定蛋白,且均为不含信号肽的亲水性蛋白,除CL10714.Contig1为膜结合转录因子外,其余均不含跨膜结构.芒果bHLH蛋白结构域有多个氨基酸位点保守性较高,87个芒果bHLH蛋白中73个(83.91％)具有E-box结合功能.GO分析发现芒果bHLH蛋白共注释到生物学过程、细胞组分和分子功能3大类功能的17个亚类.进化树分析发现芒果bHLH蛋白与拟南芥有较高的保守性,并基于进化树对部分bHLH蛋白的功能进行了预测.本研究结果将为下一步芒果bHLH蛋白的功能研究奠定基础.