黄瓜单链DNA结合蛋白基因CsWHY1的克隆及表达分析

• 作者: 张璐 李季 沈佳 王星 袁高雅 赵宇 陈劲枫
• 来源期刊: 南京农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 黄瓜 CsWHY1基因 叶片衰老 基因克隆 表达分析
• 年，卷（期）: 2019,（2）
• 所属期刊栏目: 植物科学
• 页码范围: 246-252
• 页数: 7页
• 分类号: S642.2
• 字数: 4601字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7685/jnau.201804038

摘要

[目的]单链DNA结合蛋白Whirly (WHY)是植物体内广泛存在的一类转录因子,在植物叶片衰老等方面具有重要作用.本文旨在克隆黄瓜单链DNA结合蛋白基因CsWHY1,初步分析其表达特征,为黄瓜叶片衰老的功能研究提供参考.[方法]以华北型黄瓜‘9930'‘长春密刺’和‘新泰密刺’为试验材料,克隆CsWHY1的cDNA全长,应用生物信息学方法对该基因进行生物信息学分析,并利用洋葱表皮细胞瞬时表达系统对CsWHY1蛋白进行亚细胞定位,同时通过RT-qPCR技术分析CsWHY1基因在3个黄瓜品种不同组织中的表达模式.[结果]CsWHY1基因包含1个长度为831 bp的开放阅读框(ORF),共编码276个氨基酸,蛋白理论相对分子质量为30.729× 103,理论等电点(pI)为9.00,属于亲水蛋白.氨基酸序列分析表明,CsWHY1蛋白具有保守的Whirly结构域,在双子叶植物和单子叶植物中高度同源,且与甜瓜亲缘关系最近.亚细胞定位发现CsWHY1蛋白在洋葱表皮的质体上表达.荧光定量PCR分析其表达模式,发现CsWHY1在不同黄瓜品种不同组织中均有表达,叶片中表达量最高,根和茎中表达量较低,其中衰老叶片中的表达量显著高于成熟叶片.[结论]CsWHY1基因的表达具有组织特异性,在衰老叶片高表达,参与了黄瓜叶片衰老进程.