苏姜猪线粒体基因组全长测序及线粒体基因多样性分析

• 作者: 张晨岭 王洁 郭浩君
• 来源期刊: 南京师大学报（自然科学版）
• 学科: 农学
• 关键词: 苏姜猪 线粒体基因组 遗传多样性 系统发育
• 年，卷（期）: 2019,（4）
• 所属期刊栏目: 生命科学
• 页码范围: 97-102
• 页数: 6页
• 分类号: S828.8
• 字数: 2884字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-4616.2019.04.014

摘要

从分子水平上探究苏姜猪的遗传多样性,采用二代测序方法测定了苏姜猪线粒体基因组全序列,整合NCBI数据库中已公布的家猪类,以及本实验室测定的苏姜猪线粒体基因组全序列,使用蛋白编码基因和rRNA基因联合的数据集,基于贝叶斯法(BI法)和最大似然法(ML法)构建了家猪类的系统发生树,测序结果表明,该样本线粒体基因组全长15436 bps,包含典型的家猪类线粒体基因组37条基因,结构紧凑,其线粒体基因组碱基组成(A+T)约占40％,(C+G)约占60％,tRNA总共有8处错配,结果表明苏姜猪具有丰富的遗传多样性,江海型线粒体核苷酸多态性高于全国6个类型猪的平均水平,体现了其独特的遗传多样性.在基于线粒体基因组完整编码区的系统发育分析中,苏姜猪在中国6个类型家猪中单独成为一支,支持其作为一个新猪种而存在.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王洁		24	45	4.0	4.0
2	张晨岭	南京农业大学动物科技学院	6	2	1.0	1.0
4	郭浩君	江苏第二师范学院生命科学与化学化工学院	1	0	0.0	0.0