生物信息学分析miR-203与VEGFA相互作用在胎盘发育中的意义

• 作者: 刘福林 汪虹
• 来源期刊: 武汉大学学报（医学版）
• 学科: 医学
• 关键词: 胎盘 生物信息学 miR-203 VEGFA 先兆子痫
• 年，卷（期）: 2019,（1）
• 所属期刊栏目: 临床医学研究
• 页码范围: 147-152
• 页数: 6页
• 分类号: R714.56
• 语种: 中文
• DOI: 10.14188/j.1671-8852.2018.0308

摘要

目的:通过比较正常发育情况下胎盘的基因表达谱及先兆子痫(PE)发生条件下的胎盘基因表达谱,从中找到在两者中具有共性的特征基因.方法:从Gene Expression Omnibus数据库中下载不同胎龄的正常人胎盘(GSE9984)和先兆子痫人胎盘微阵列数据(GSE6573)的基因表达谱.差异表达基因(DEGs)分析由GEO2R进行.基因组富集分析(GSEA)使用GSEA v3.0软件进行.TargetScanHuman数据库、miRTarBase数据库及mirRDB数据库用于分析可靠的miR-203作用靶基因.MiR-203与靶标基因的互作网络可视化由Cytoscape构建.结果:比较两组基因表达谱后得到共同基因10个,包括LNPEP、AKNA、SLC9A7、VEGFA、FUT9、STRBP、TMEM144、LPAR6、ERCC6L、TRAP1.通过将表达谱中比较后得到的共同基因与miR-203的靶基因进行比对,发现miR-203与VEGFA之间的作用均存在于PE发生与正常胎盘发育中.结论:MiR-203与VEGFA之间的作用可能在PE发生发展与正常胎盘发育中起着重要的作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘福林	武汉大学中南医院妇产科	12	68	6.0	8.0
2	汪虹	武汉大学中南医院妇产科	3	3	1.0	1.0